Die Risikofaktoren für eine Zystitis sind umfangreich. Zu ihnen zählen etwa falsches Miktionsverhalten, geringe Trinkmenge, anatomische Verhältnisse wie Stenosen oder funktionelle Einschränkungen (z. B. durch einen vesikoureteralen Reflux), Diabetes, rezente Antibiotikaeinnahme und vermehrte sexuelle Aktivität.